1910.11.20 (日明治43年，民國前2年)
湖西區長許萬發與隘門區長黃奢提出湖西公學校設立區域變更申請，向臺灣總督府申請設立湖西公學校隘門分校

1911.03.31(日明治44年，民國前1年)
公布設立「湖西公學校隘門分校」（4月1日起）於隘門鄉，學區包含雙頭掛、烏崁、隘門、林投、太武、大城北等6個聚落，採4年制教學，開校日期為4月20日

1918.04.01(日大正7年，民國7年)
升格獨立設校為「隘門公學校」，首任校長為臺灣公學校教諭十時算，當時學有有教員4位，學童188名（男183、女5），校地面積0.3050甲，建物面積97.77坪

1922.04(日大正11年，民國11年)
改制為「湖西第二公學校」

1924(日大正13年，民國13年)
由湖西第一公學校校長兼任本校校長

1941.04(日昭和16年，民國31年)
因應日治時期〈國民學校令〉，改稱「湖西國民學校隘門分校場」

1942.04.01(日昭和17年，民國32年)
改設「澎湖廳隘門國民學校」於湖西庄隘門1386番地，任命外山喜一郎為校長，新建教室6間、辦公室1間、廁所1間、宿舍2間、操場1200坪、農園1處

1945.11(民國34年)
二次大戰後，台灣省澎湖縣接管委員會派陳領接任校長

1946(民國35年)
澎湖縣政府成立，改制為「澎湖縣立隘門國民學校」，設置5班，教職員6名（5男1女），學區包含隘門與林投，9月黃秀雄接任校長

1947(民國36年)
改名「澎湖縣湖西鄉隘門國民學校」

1951(民國40年)
地方行政區域變更，學區改為隘門村、林投村、太武村，並興建4間教室（今校址南側民房）做為辦公室與低年級教室，高年級借民房上課

1964(民國53年)
 港底國民學校設立，澎湖縣政府於11月正式將武城村中大城北聚落劃入該校

1965(民國54年)
行政區改制，學區改為隘門村、林投村、太武村

1968.01(民國57年)
旅臺鄉親洪四川等人捐款購買北側1,200坪土地興建操場

1968.09(民國57年)
配合實施義務教育，奉命改名「澎湖縣湖西鄉隘門國民小學」，黃秀雄接任校長

1976-79(民國65-68年)
家長會購置與整平操場前後操場，並捐款興建綜合體育館；1977年增建北側新校舍，學校空間整體向北側移動；1979年遷入，編制12班

1987(民國76年)
北側教室增建為二樓

2006.11(民國95年)
榮獲全國推展體育績優學校

2007.03(民國96年)
校舍重建，學童遷入南側綜合體育館上課，體育館下方室內停車場作為臨時辦公室

2009.02(民國98年)
校舍竣工，學童遷入目前新校舍上課

2010.04(民國99年)
操場整建與合成橡膠跑道完工